Penampilan kolaborasi memang momen paling ditunggu-tunggu oleh para penggemar. Karena mereka bisa melihat interaksi dan kekompakan antar member grup yang berbeda. Di acara ‘MBC Gayo Daejun 2016’ kali ini pun terdapat 4 penampilan kolaborasi diantaranya Bomi-Namjoo A Pink dengan Eunkwang-Changsub BTOB dengan membawakan lagu ‘Angel Without Wings’ (Roo’Ra).

Kemudian selanjutnya adalah Hani EXID-Seolhyun AOA-Tzuyu TWICE dengan lagu 'To My Boyfriend’ (Fin.K.L), Hyorin-Soyu Sistar dan Jooheon-I.M Monsta X dengan lagu ‘Sexy Man’ (Space A) dan terakhir adalah Dongwoo-Hoya Infinite dan ChoA AOA dengan ‘Tell Me’ (Jinusean).