‘Chocolate’ mengisahkan tentang tentang seorang pria dan wanita yang bertemu sebagai anak-anak dan menghadapi keadaan yang sangat tidak menguntungkan yang membuat mereka berpisah.

Mereka mengalami beberapa peristiwa tragis, dan kemudian takdir mempertemukan mereka kembali saat mereka telah dewasa. Lee Kang (diperankan oleh Yoon Kye Sang) menjadi ahli bedah otak yang sukses, dan Moon Cha Young (diperankan oleh Ha Ji Won) adalah seorang koki.

Lee Kang dan Moon Cha Young sama-sama mengalami banyak moment kehilangan di usia muda. Saat trauma menghantam Moon Cha Young, dia menjadi tidak bisa mengatasinya, dan memaksanya untuk mengubur ingatan.

Setiap kali dia dipicu oleh sesuatu dalam hidupnya, dia mendapat serangan panik yang parah dan sering membuatnya pingsan. Ketika dia bertemu Lee Kang, dia menyadari peristiwa apa yang dia telah terkubur begitu dalam di dalam dirinya. Dia juga mencari cara untuk mengatasinya sehingga dia bisa menjalani hidupnya dalam kebebasan.